Este capítulo provee un breve resumen del trabajo mas relevante sobre marcadores biológicos y enfermedades que han contribuido al campo de la biodemografía en Centro América y el noroeste de Sudamérica. Se reconstruyó la historia de las poblaciones que habitan ambas regiones a través de registros históricos y de la abundante información proporcionada por los estudios con marcadores biológicos que revelan aspectos demográficos de las poblaciones antes y después de la conquista y colonia europea. Estos estudios consideran un poblamiento original de norte a sur del continente desde Asia, alta similitud genética entre las poblaciones aborígenes de Centro América y el suroeste de Sudamérica debido a las migraciones retrógradas impuestas por las densas selvas de la Amazonia, y grados variables de mezcla tricontinental en las poblaciones modernas con un gran sesgo de género. Rastros del colonialismo europeo persisten hoy en día e influencian la desigualdad, la violencia, y las migraciones locales internacionales masivas, que a su vez moldean los paisajes epidemiológicos. Finalmente, las transiciones económica, demográfica y nutricional están mejorando la calidad de vida de la gente en ambas regiones. Sin embargo, las transiciones imponen nuevos retos en salud pública debido a la influencia de los problemas típicos del mundo desarrollado, tales como aumento de prevalencia en las enfermedadescardiovasculares y degenerativas.